O topônimo Juquiá foi instituído pela Lei nº 9.073, de 31 de março de 1938. Juquiá, no tupi pode significar: rio sujo, espinho de fruta ou covo para peixe; mas parece que o primeiro é o que melhor explica, pelas águas escuras que banham a cidade. Em dezembro de 1948 foi elevado a Município. Juquiá tem na cultura da banana o seu principal produto, justificando o cognome de Capital da Banana.